NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit Brings Accelerated AI to Life Sciences Researchers in Claude Science
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12 条评论 | 2020 年 12 月 17 日
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生命科学已进入计算规模时代，十多年来，英伟达构建了完整的 GPU 加速计算堆栈——涵盖硬件、框架、库、模型、微服务和特定领域工具——以帮助研究人员运行更复杂的九游娱乐工作流程并更快地进行迭代。
本周，Anthropic 发布了 Claude Science，这是一个面向科学研究的 AI 工作台，可让科学家以自然语言与代理进行对话，从而端到端地完成工作。
Claude Science 集成了英伟达 BioNeMo Agent Toolkit，作为科学家在其工作流程中可以访问的资源。该工具包将英伟达加速功能打包为可调用的技能，使 Claude Science 能够选择合适的工具、准备有效的输入并执行工作流程——同时连接到部署在任何地方的英伟达计算资源。这将英伟达的加速模型、库和英伟达 NIM 微服务直接引入到其余研究发生的环境中。
全球最大的制药公司使用英伟达技术来推进药物发现、基因组学、医学成像、分子设计和蛋白质工程领域的 AI 驱动研究。如今，排名前 20 的制药公司中有 18 家使用英伟达 BioNeMo，这凸显了其在整个生态系统中的广泛作用。
推进科学发现的代理时代
Claude Science 允许科学家使用自然语言将研究从意图转化为行动，而无需手动配置模型、端点或软件环境。英伟达 BioNeMo Agent Toolkit 通过访问加速工作流程和模型（如 Evo 2、Boltz- 2 和 OpenFold 3）来扩展这一点，从而加速受益于加速的分析。
科学家首先用自然语言描述一项研究任务，例如分析基因组序列、预测蛋白质结构或设计潜在的结合剂。Claude Science 会解释请求，并通过预先配置的、了解基因组学、蛋白质组学、单细胞分析、化学信息学和临床研究领域既定工作流程的领域专业代理来协调工作。
BioNeMo Agent Toolkit 为这些代理提供了连接每个步骤与适当的英伟达科学能力所需的上下文。每个技能都包含有关其目的和所需输入的信息，帮助代理准备和执行工作流程，并返回输出供审查。
结果是科学推理和加速计算工作之间的迭代循环。科学家可以在保持对科学的关注的同时，检查输出、完善问题并确定下一步。
一个有力的例子是生成更好的常见癌症靶点抑制剂。在此工作流程中，科学家从已知的致癌抗原突变开始，并要求 Claude 设计多种潜在抑制剂。Claude Science 集成了 BioNeMo Agent Toolkit 和英伟达 NIM 微服务，加速了高通量抑制剂预测、优化和验证。
为代理构建的科学基础
AI 代理进行推理、规划并使用工具来完成任务。在生命科学领域，这些工具通常是专业的计算工作流程。
自主 AI 科学家代理并非孤立地进行推理。它可能需要对化合物库进行指纹识别、对有希望的命中进行聚类、为顶级候选者生成构象、分析基因组上下文并比较扰动响应，然后才能推荐下一步实验。
每个步骤都依赖于一个科学工具，而代理的运行速度只能和这些工具的运行速度一样快。
英伟达 BioNeMo Agent Toolkit 为科学代理提供了以科学速度运行所需的加速工具。它包括：
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